четверг, 19 марта 2020 г.

Гугл прислал $52.12 за февраль

И это не деньги за рекламу. А это значит, что в наших андроидных приложениях появились покупки, которые до этого были только на iOS. Теперь за пару долларов можно отключить рекламу или купить дополнительные подсказки. До 1 марта были обновлены только пять приложений: Породы собак – еще в декабре; важное приложение о Столицах мира; и в самом конце месяца Животные, Фрукты и Простые слова:


Мой брат переписал весь код на Java под нативный Android. В процессе много ругался на криворукость программистов Google, утечки памяти в AdMob, тормознутость Android Studio. Но зато у нас появилась такая фича, как переворот экрана в альбомный формат. Мой телефон зафиксирован в портретном режиме, но на планшете такое может пригодиться:


Я попробовал учиться программировать, но бросил. Мы лучше работаем, когда мой брат – главный повар, а я поваренок при нем. Он может написать скрипты, чтобы автоматически снялись скриншоты на всех языках, но пока мой труд дешев, мне поручено снять и загрузить их вручную (я поставлю себе какую-нибудь лекцию и под нее нажимаю Cmd+S 30 x 7 = 210 раз).

Потому что в “Столицах” мы довели число языков, на которые переведены наши географические приложения, до 30. Добавились хорватский, словенский, болгарский, литовский, индонезийский, малайский и вьетнамский. Разделение португальского на бразильский и собственно португальский варианты я за отдельные языки не считаю. Все эти переводы я готовил, пока брат переписывал код, поэтому я очень рад, что моя многомесячная работа в стол наконец-то дошла до пользователей.

Сейчас сравнил скачивания и доходы в “Столицах” в месяц до и после обновления. Общие доходы выросли в полтора раза. Но в тех странах, чьи языки мы только-только добавили, рост значительно выше – в 2–12 раз, но они до обновления были почти нулевыми. Например, в Болгарии доходы от рекламы выросли с $2.42 до $8.52. Негусто. Но это дополнительные $6 с одного эппа за один месяц. Уже окупило перевод на болгарский, который я заказывал на fiverr. И это не случайная флуктуация. Показателен пример Литвы и Латвии. Изучая, на каких языках установлены наши приложения, я решил добавить литовский, но не латышский. И в Литве рост доходов в 5 раз, а в Латвии в 1,3 раза – как в среднем по всему миру.

В “Столицах”, как и в обновленных во вторник Флагах мира, мы добавили уровни, где столицы/флаги разбиты по континентам:


И мы разделили игровые режимы с 4 вариантами ответов и “игру на время” каждый на два режима. Раньше у нас вопросы задавались в случайном направлении: или дан флаг и 4 варианта ответов-стран, или дано название страны и 4 варианта ответов-флагов. Теперь это два разных режима, чтобы люди сами выбирали, как им удобнее учить. Зато сколько звезд можно заработать, проходя уровни, при той же базе данных:


Базу данных я слегка обновил. Мне чуть ли не каждый день писали, что в Казахстане переименовали столицу. Реже писали о том, что Македония теперь официально называется Северная Македония или что Свазиленд стал Эсватини. И совсем мало людей знают, что в Бурунди перенесли столицу из Бужумбуры в Гитегу. Я получал эти письма, но ничего не мог поделать, пока брат не обновит код. Потому что обновлять старый “кокосовский” код он не хотел, а с той же рекламой уже вышли новые библиотеки.

Глюки и баги в cocos2d-x были одной из причин перейти на нативный Андроид. В итоге в “Столицах”, например, количество вылетов приложения уменьшилось в 10 раз: с 0.40% до 0.04% от всех сессий. Но все равно остались мелкие ошибки в рекламной библиотеке и гугловской системе покупок, который мой брат исправить не может (хотя ему волю дай, он за гугл весь Андроид бы переписал, но нам надо следующие приложения обновлять).

Пока в марте мы еще успели обновить приложения Известные люди, Города мира и Породы кошек. Везде были внесены незначительные изменения, вроде переводов на новые языки, или на иконке приложения о людях я убрал портрет Че Гевары, который смущал некоторых пользователей, и поместил туда Виктора Гюго.

Из разных технических мелочей мы добавили “прогресс-бар” – зеленую полоску, которая показывает продвижение к получению звезды. После того, как в игре на время закончилась одна минута, теперь можно получить 20 дополнительных секунд за подсказки. Секундомер перестал идти на первом вопросе, и мы убрали десятые доли секунды, которые только мельтешили и отвлекали.

Во “Флагах” изменился вид карточки, теперь на ней еще и карта показывается. Мы вообще планировали когда-то превратить этот эпп в “географический комбайн” – объединить все наши разрозненные географические приложения в одно. Чтобы не отдельно флаги, столицы, карты, а все в одном:


И будем смотреть, сколько принесут покупки в Google Play. На iOS они составляют малую долю доходов по сравнению с рекламой. В GP пользователь платит еще налог с продаж (в зависимости от страны или штата), потом гугл берет 30%, а потом мы со своих доходов еще подоходные налоги должны платить. В штате Вашингтон Google обязан собирать и платить все sales taxes за меня. Вот жил бы я в Юте, это была бы моя обязанность. Но у нас пока из США было всего три покупки (лучше всего покупают в Германии): в Нью-Мексико, Теннесси и Западной Виргинии – не самые ожидаемые штаты.

А с доходами от рекламы все более-менее стабильно. Только вот стоимость рекламы – сколько нам платят за тысячу показов – в последние дни пошла вниз вместе с финансовым рынком. Но мы не отвлекаемся и продолжаем работать по заранее намеченному плану.

среда, 11 марта 2020 г.

Коронавирус и я

Сегодня губернатор штата Вашингтон объявил, что все собрания больше 250 людей одновременно запрещаются в штате до 31 марта. 249 можно, а 250 уже нельзя. Был бы он республиканским губернатором, он бы такую штуку не принял, но откуда в Вашингтоне взяться республиканскому губернатору.

Seattle Symphony, которая держалась до последнего, супротив губернатора не пошла и отменила все мартовские концерты, включая концертное исполнение “Саломеи” Р. Штрауса 19 марта, на которое мы собирались пойти. Что там будет с компенсацией за билеты, еще непонятно. Но это уже второй концерт, который у нас отменили из-за коронавирусной паники.

Первым был концерт любительского оркестра PSSO в прошедшую субботу. Губернаторского указа тогда еще не было, но они решили сами перестраховаться и “перенесли концерт онлайн”, что равнозначно его отмене. Потому что трансляция на фейсбуке была ужасного качества, лучше бы нормально записали и выложили потом запись на ютуб. Но на ютубе я и так могу разную музыку и исполнителей послушать, на живые концерты ходишь не за этим. На PSSO у нас были куплены билеты на весь сезон, они дешевые, и им я готов их стоимость пожертвовать. А вот прощать $138 Seattle Symphony не хочу.

Если бы не концерты, я бы вообще не заметил, что в городе что-то изменилось. Людей и машин на улице столько же, сколько и всегда. Мы ходили дважды есть в тайские рестораны: люди там есть, цены не уменьшились, никто не закрывается и не паникует. В магазинах все, что мы хотели купить, все есть. Хорошо, в Whole Foods не было бейглов, но они их, похоже, просто перестали печь. Туалетную бумагу в некоторых местах расхватали по принципу, что если все берут, то и нам надо. Но вот бумажные полотенца или мыло стоят рядом как ни в чем не бывало. Могли пострадать лавки, которые втридорога торгуют китайскими сувенирами для туристов. Но их мне не жалко.

Вообще народ разделился в отношении к вирусу по партийным линиям. Линия демократической партии, что в эпидемии виноват лично Трамп, а вирус – это очень страшно и надо срочно что-то отменить и запретить в духе нашего губернатора. Линия республиканцев – грипп опаснее, ездить на машине опаснее, ходить без шапки опаснее, надо жить, как жили раньше. И я, как это часто бывает, оказался в республиканском лагере. Вся эта паника нанесет такой удар по экономике, что от экономических потерь больше людей помрет, чем от вируса. Такая аутоиммунная болезнь общества, когда ответ неадекватен опасности.

Трамп, конечно, мог бы действовать похитрее. Он же знает, что “если Трамп против колхозов, то журналисты за”. Когда в конце январе он закрыл авиасообщение с Китаем, журналисты ругали его, что он действует против рекомендаций ВОЗ, что такие меры преждевременны. Надо было ему истерить, требовать закрыть границы, отменить полеты, ввести чрезвычайное положение, глядишь, журналисты бы заняли позицию, что коронавирус не страшнее гриппа, лишь бы не подпевать Трампу.

Байден выступал, что вот он лично остановил эпидемию эболы в США в 2014 году. Он вообще любит записать себе все положительные итоги обамовского правления, а все отрицательные, вроде депортации 3 млн мексиканцев, свалить на Обаму. Только почему-то в 2014 году эпидемии эболы больше нигде в развитом мире не было, не только в США. Зато сейчас коронавирусом, где только ни болеют. Как шутили про призыв в российскую армию: нет здоровых стран, есть недообследованные.

Если верить официальной статистики, США надо брать пример не с Канады, где больше 100 больных, а с Мексики, где больных всего 8 человек. Или с путинской России. А еще лучше с назарбаевского Казахстана, который, несмотря на границу с Китаем, не сообщил ни об одном заболевшем. Ну, уж точно не надо брать пример с Европы: что там в Швеции, на которую нас призывал равняться Берни? 500 больных. А в Дании? 444. Нет, такое здравоохранение нам не нужно. В пересчете на душу населения при Трампе-то получше будет. Вот кто Европе мешал подготовиться и предотвратить эпидемию? Тоже Трамп?

За наш бизнес я не переживаю. Чуть-чуть упала стоимость рекламы вместе с рынком, но ожидается, что востребованность онлайн-образования только возрастет. В любом случае мы накопили достаточно ресурсов, не имеем бизнес-расходов и получаем доходы со всего мира. Я даже жду кризиса, чтобы он почистил мобильный рынок от неэффективных игроков. Чтобы как в библейской сказке про “семь коров тучных и семь коров тощих”, они пришли к нам на поклон.

В плане концертов у нас еще с прошлого лета запланирована поездка в Чикаго в середине апреля. Штат тоже демократический, могут поотменять все в любой момент. Или вообще закроют Сиэтл на чумной карантин. В мае должен быть еще один концерт PSSO. Больше никаких планов нет. Праймериз закончились, сидим теперь наблюдаем, как вирус расползается по карте, а политики его ловят. Кстати, Трамп-Трампом, но что мешало нашему губернатору ввести подобное чрезвычайное положение в январе, когда в нашем штате обнаружили первого заболевшего в США? Нет ответа.

Я вижу два варианта развития событий: 1) станет теплее, и все выздоровеют; 2) больных будет много, тысячи, если не миллионы, но все поймут, что нельзя вот так сидеть, бояться и ничего не делать, и вернутся к обычной жизни, но с коронавирусом на заднем плане. В третий вариант, что это реально опасная эпидемия, от которой умрет больше американцев, чем от гриппа (то есть больше 20000 человек), я пока не верю.

среда, 4 марта 2020 г.

За кого я проголосовал на праймериз

1. Я сторонник сменяемости власти. Президент старается выполнить свои предвыборные обещания в первый срок, а на втором у него уже нет мотивации, и он превращается в так называемую “хромую утку”.
2. За политикой я наблюдаю со спортивным азартом, поэтому мне нравится политический цирк, чтобы Президент и Конгресс дубасились до импичментов и шатдаунов.

Остались три серьезных кандидата: Donald ‘Lame’ Duck, Sleepy Joe (у которого программа “Все будет как при Обаме”) и Crazy Bernie. Если исходить из двух указанных критериев, то голосовать я должен за сенатора Сандерса:


Я смотрю все дебаты (на удвоенной скорости), поэтому имею право требовать дебаты Сандерс–Трамп, а не Байден–Трамп. Мой сегодняшний выбор не имеет отношения к тому, как я проголосую на general elections. Было время, смотрел я футбол и болел за сборную Голландии, но когда Россия играла с ними на Евро 2008, то, конечно, я болел за Россию.

В штате Вашингтон праймериз заканчиваются 10 марта, но так как тут голосование исключительно по почте, то у меня было три недели, чтобы определиться с выбором. Я решил подождать результатов “супервторника”. Мне вообще больше всех нравился Эндрю Ян, который пророчествовал, что скоро роботы займут все рабочие места и поэтому людям надо платить $1000 в месяц за просто так. Но он снялся после Нью-Гэмпшира.

Одно время я раздумывал насчет Блумберга, но он был скучен на дебатах и закидал почтовый ящик макулатурой. Хотя бы придумали какой-то интересный дизайн, чтобы глаз цеплял и хотелось прочитать, что он там обещает:


А тут оказалось, что и Блумберг снялся. И демократическая партия, кажется, уже решила, что “лучше с умным потерять, чем с дураком найти”, то есть лучше проиграть с Байденом, чем выиграть с Сандерсом. Потому что с дураком найти нельзя. Но мне эти праймериз тем и нравятся, что лидер уже неоднократно менялся. И политолухи твердили: “Байден победит, нет, Сандерс, точно не Байден, точно Сандерс, или Блумберг, или все же Байден, или Сандерс, или Байден, ну, теперь точно Байден” Вот модель от сайта fivethirtyeight:


Это еще до супервторника. Один-два дня, и все меняется с ног на голову. Вот такой футбол я люблю. Пусть теперь Берни, если не догонит, то помешает Джо набрать 50% делегатов, а то все совсем скучно станет (до осени).

В штате Вашингтоне многие жаловались, что на этих выборах надо на конверте отмечать, в праймериз какой партии участвуешь. Тут нет партийной регистрации избирателей, но только на этих выборах надо в бюллетени выбрать или одного демократа, или одного республиканца:


Многих напрягало, что этот партийный выбор рядом с твоим именем, станет общедоступной информацией. Мало ли, пойдут по квартирам стыдить сторонников Трампа. Потому что у респов выбор из одного кандидата. Я такое не люблю. Да, мог бы вписать сенатора-либертарианца Рэнда Пола или отметить Трампа – послать ему сигнал, что в самом центре Сиэтла у него есть сторонники. Но респы настолько на Сиэтл не рассчитывают, что решат, что это местные леваки перекурились и троллят своих друзей.

Поэтому сегодня Сандерс. А плюсы и минусы Трампа обсудим в ноябре. Посмотрим, кто в итоге пойдет от демов, на позиции вице-президента в том числе. Когда президенту под 80, личность вице-президента становится важной, даже безо всяких китайских вирусов.

понедельник, 10 февраля 2020 г.

Читаю книги по истории науки

Прочитал две автобиографии: “What Mad Pursuit” Фрэнсиса Крика и “The Third Man of the Double Helix” Мориса Уилкинса. Я дважды читал “Двойную спираль” Джима Уотсона – вначале по-русски, а потом по-английски – и каждый раз был очень впечатлен. А вот сейчас появилось желание взглянуть на казалось бы известную историю открытия структуры ДНК глазами других участников.

Книга Крика мне тоже очень понравилась: он оптимист, сыпет анекдотами и мыслит глобально. А вот Уилкинс и пишет занудно, и оказался вообще несколько пришибленным персонажем (другие читатели в своих отзывах используют слово self-effacing). Так ноет, будто это ему в итоге не дали Нобелевскую премию. И по мере чтения у меня появилось желание, чтобы ему ее не дали. Пусть лучше бы третьим включили Эрвина Чаргаффа, который экспериментально установил, что в ДНК примерно одинаково цитозинов + гуанинов и тиминов + аденинов. Тем более, что премию дали по физиологии и медицине, поэтому можно было бы упирать на биологическое значение нуклеотидных пар, а не на спиральность молекулы.

Крик, кстати, истории ДНК уделяет относительно мало глав, потому что Уотсон и так все написал. По утверждению Крика история установления структуры коллагена – который составляет треть от всех белков в нашем организме – была не менее драматическая и запутанная, как с точки зрения науки, так и человеческих взаимоотношений. И Крик в ней тоже тоже принимал участие, но не нашлось своего “доктора Уотсона”, который описал бы в красках коллагеновую эпопею. Ну, или не нашлось такого персонажа как Розалинд Франклин, которую первой вспоминают сейчас, когда заходит речь о книге Уотсона, и о которой бы почти никто не знал, если бы Уотсон не написал свою книгу. Или написал ее в виде сухого отчета, а не литературного произведения со свойственными литературе преувеличениями ради драматического эффекта.

Крик пишет, что никто Франклин не обижал, и если кто-то был против того, чтобы она занималась наукой, так это ее богатая еврейская семья, которая считала, что Розалинд лучше выйти замуж и воспитывать детей. Уилкинс прямо пишет, что главная цель его автобиографии – оправдаться перед феминистками, которые сделали его главным злодеем. Он ее не убивал. Она сама умерла от рака в 37 лет (уж не знаю, сказалась ли тут ее работа по рентгеновскому изучению угля и вирусов). И если бы она прожила дольше, то сама успела бы написать, как все было на самом деле и что она ни на кого зла не держит. Что он, Уилкинс, начал исследовать ДНК до того, как Розалинд присоединилась к их лаборатории, и продолжил после того, как она ушла. Что Розалинд Фраклин была одной из многих его коллег в King’s College London, которые работали над структурой ДНК. Но все помнят почему-то только ее.

Крик и Уилкинс – заинтересованные лица, я не могу им однозначно во всем верить. Но я согласен, что проживи Розалинд Франклин дольше, у нее не было бы ореола мученицы за науку. Если бы даже ее не включили в Нобеля 1962 года, ей бы с большой вероятностью дали Нобеля в 70-80-е (в 1982 году НП по химии получил Аарон Клуг, с которым она продолжила работать над вирусами после перехода из King’s College в Birkbeck College). Например, очень мало, кто знает о Дороти Кроуфорд-Ходжкин, которая тоже была женщиной-кристаллографером, но при этом прожила долгую жизнь, была профессором в Оксфорде, получила Нобеля, родила троих детей и установила структуру моего любимого витамина B12.

А о Розалинд Франлин, окончившей жизнь трагически в 37 лет (как Пушкин или ваг Гог), пишут пьесы и называют в ее честь марсоходы. (Но марсоход запустят только этим летом, и он еще может разбиться при посадке на Марс, как предыдущий российско-европейский аппарат “Скиапарелли”). И в наше приложение об Известных людях (iOS, Android) мы ее тоже включили, потому что каким бы ни был ее научный вклад, в общественном сознании она стала известным ученым:


Параллельно чтению книг, я, наконец-то, прочел три классические статьи в Nature от апреля 1953 года. Первая Крика и Уотсона – очень четкая и понятная. А если говорить о том, что не раздается должный кредит, то Уилкинса и Франклин они как раз в статье благодарят, а вот то, что иллюстрацию со структурой ДНК нарисовала жена Крика Одайл, которая была художницей, нигде не указано:


Статью Уилкинса я решительно не понял, хотя после чтения этих книг у меня прибавилось знаний о том, что собой представляет рентгеноструктурный метод. Статья Фраклин чуть понятнее, но все равно я не могу объяснить, что они видят на вот этих картинках:


Это знаменитая “фотография 51”, которую Уилкинс якобы украл у Франклин и показал Уотсону. Начнем с того, что не сама Франклин сняла эту фотографию, а ее аспирант Рэймонд Гослинг, который догадался намотать ДНК на канцелярскую скрепку. С кристаллами они не работали, о том, чтобы увидеть отдельные атомы и речи не шло (окончательно, что ДНК – двойная спираль, подтвердят только в 1980-е, когда появятся компьютеры и соответствующие приборы), изучали некую упорядоченность в “паракристаллическом” состоянии.

И когда Франклин собралась уходить из King’s и передать Гослинга обратно под руководство Уилкинса, она разрешила показать ему неопубликованные данные. И в результате это фото будет опубликовано именно в статье под именами Фраклин и Гослинга (кто помнит Гослинга?), а не Крика и Уотсона. Насколько неэтично было показывать неопубликованные данные Уотсону – другой вопрос. А я вот скажу, что неэтично сидеть на экспериментальных данных и не публиковать их. Хотя бы по отношению к собственным студентам, которые эти данные получили и имеют право на публикацию. В современном мире я вполне отстаиваю подход, что экспериментальные данные должны выкладываться онлайн в реальном времени, а потом историки разберутся, кто был первым. (Эти три статьи, кстати, были опубликованы без peer review в рекордно короткие сроки, потому что самый большой руководитель Уилкинса и Франклин – сэр Джон Рендалл – состоял в одном клубе с главным редактором Nature; arxiv.org тогда не было).

Крик в своей книге размышляет, что если бы Уотсона прибило теннисным мячом, то он сам один не стал бы разгадывать структуру ДНК. Он вообще был тогда всего лишь аспирантом, работающим над структурой белков, а не нуклеиновых кислот. Но ее не установила бы Франклин, потому что у нее и так были все данные, но она решила перейти в другой колледж на другой проект. Не установил бы и Лайнус Полинг, потому что он уже опубликовал свою структуру ДНК (неправильную) и был ей вполне доволен. Крик предсказывает, что в таком случае до структуры ДНК через 2–3 года допер бы Уилкинс.

И сам Уилкинс, как бы в ответ, сокрушается, что если бы они с Франклин работали так же дружно, как Крик работали с Уотсоном, то они бы еще раньше нашли правильную структуру: у Франклин была фотография, и она рисовала двойную спираль в своих черновиках, а Уилкинс думал о правиле Чаргаффа и объединении нуклеотидов в пары. Но Франклин думала, что Рендалл полностью передал ей проект по ДНК и не хотела ни с кем кооперировать. А Уилкинс боялся Франклин и не мог даже попросить у нее ДНК для своих опытов.

Он, как я уже сказал, был несколько пришибленный. Состоял в студенческие годы в коммунистической партии и вышел только в 1939 году, когда после нападения СССР на Польшу и Финляндию быть за коммунистов стало совсем стыдно. Но и потом всю жизнь боролся за мир, ходил на демонстрации и подписывал петиции. При этом увлекался искусством и ходил к психоаналитику. Когда его занесло в Южную Америку, он не отправился ловить гигантских кальмаров, сперма которых особенно подходила для изучения ДНК, а вместо этого отправился в Куско и Мачу-Пикчу любоваться керамикой инков.

В начале 50-х структуру ДНК вообще много кто предлагал. Был в King’s College австралийский студент Брюс Фразер, который раньше всех предложил структуру в виде спирали с фосфатами снаружи и нуклеиновыми основаниями внутри, держащимися водородными связями. Но это была тройная спираль, а не двойная. Так ему сказал Уилкинс на основании содержания воды и плотности ДНК. Эту модель видели и знали и Крик, и Уотсон, и Франклин, но вот сделать шаг от тройной спирали к двойной не могли. И Уилкинс удивляется, как так никто не догадался. Но вот так. На модель Фразера Крик и Уотсон ссылаются в своей статье как “(in press)”, но на самом деле манускрипт Фразера был опубликован только в 2004 году, когда был найден после смерти Уилкинса в его бумагах. И кто сейчас знает Брюса Фразера и его модель?

А кто мешал Крику и Уотсону додуматься о том, что между гуанином и цитозином должно быть три водородных связей, а не две? Сейчас, когда мы знаем правильный ответ, она там так и просится. Но они публиковали свои ранние статьи с двумя связями и между A и T, и между C и G:


Но модель Крика–Уотсона стала символом биологии, если не науки вообще. При этом я, прочитав столько всего на эту тему, затруднюсь сказать, что сделал Крик, а что Уотсон. Если эта история меня чему-то учит, то тому, что не надо бояться коллаборировать. А важным выводом из книги Крика было то, что эксперимент все же рулит. С ДНК им удалось построить теоретическую модель, но когда Крик потом попытался так же одной только мозговой работой разгадать генетический код – как информация, закодированная в ДНК, передается в белки – ему это не удалось. Какие бы красивые с математической и физической точки зрения теории он ни предлагал, они оказались неверными. Генетический код расшифровали другие люди экспериментальными методами, и логики в нем оказалось не так много: до сих пор ученые пытаются понять, есть ли она вообще, или то, какой аминокислоте какой кодон соответствует – дело слепого случая.

Когда Крику исполнилось 60 лет, он отправился в Сан-Диего в Salk Institute изучать мозг. В нейробиологии он не разбирался, но понимал, что надо браться за большие задачи. Будучи “архиредукционистом” он предсказывал, что как биология превратилась на его веку в молекулярную биологию, так и психология через 20–30 лет превратится в молекулярную психологию. Психологам виднее, так это или нет, но я вот почитал о молекулярных основах памяти, и ясной картины не вижу. Понятно, что все наши мысли, воспоминания и сознание хранятся не в волшебной душе, а в виде распределения мембранных белков, метилированной ДНК и концентрации ионов кальция в наших мозгах. Но вот детали ученые пока так и не знают, мучают током улиток, потому что 10 тысяч нейронов изучать проще, чем 100 миллиардов. И вот тут много еще будущих открытий и Нобелевских премий таится.

Об открытии ДНК много книг написано (в частности несколько биографий Розалинд Франклин), и их продолжают писать и писать. Но я решил, что надо временно переключиться и нашел в Seattle Public Library в электронном виде книгу другого Нобелевского лауреата Венкатрамана Рамакришнана “Gene Machine” об установлении структуры рибосомы. Это уже более современная история, и мне самому ближе и понятнее читать о человеке, который приехал из Индии в США получать PhD в захолустном универе в Огайо, чем о выпускниках Кэмбриджа 1930–40-х годов.

понедельник, 20 января 2020 г.

Систематическое наименование кубана

Когда я был в химическом летнем лагере после 10 класса, дали нам однажды набор заданий, среди которых было дать систематическое наименование кубану – есть такой углеводород с формулой C8H8, в котором углероды расположены в углах куба. Никакой связи с Кубой.

Википедии тогда еще не было, по имевшимся у нас книжкам Женя Ларионов разобрался, что кубан можно еще назвать пентацикло[4.2.0.02,5.03,8.04,7]октаном. Мне понадобилось некоторое время, чтобы въехать в то, как образуется это наименование, но все оказалось весьма логично. Если соединить два атома углерода мостиком из 4 углеродов (это будут атомы 1–6), затем еще мостиком из двух углеродов (их пронумеруем 7 и 8), затем соединить 1 и 6 напрямую (это третий 0 в названии), соединить напрямую углероды 2 и 5, 3 и 8, 4 и 7, то получится плоский граф, в котором при переведении в пространство вполне можно опознать кубан. И сразу видно, откуда взялись пять циклов, почему он “пентацикло”.


Все это очень хорошо и ностальгично: чем еще занимать детей летом в доинтернетовскую эпоху. Но человечество далеко продвинулось с тех пор в области автоматических номенклатурилок. Даже жадная ChemDraw разместила в сети бесплатную песочницу, где можно порисовать и назвать структуры. (Ради подобных ссылок я этот пост и пишу: вдруг кому-то еще понадобится назвать химическое соединение по IUPAC, платить тысячи долларов за настоящий ChemDraw не хочется, а пиратской версией уже совесть не позволяет пользоваться). Только что это? Во-первых, они не хотят давать “пентацикло” название (потому что предпочтительное название с точки зрения IUPAC “кубан”, и не надо выпендриваться). А, во-вторых, cubane он дает только для плоского графа, а для кубика добавляет еще кучу ненужных (?) стереодискрипторов:


Я вот вам не объясню, откуда взялись эти 1s,2s и так далее. Незамещенный кубан имеет точечную группу симметрии Oh, не должно быть никаких хиральных и прохиральных центров. Поигрался еще с названиями, убедился, что имеются в виду именно псевдоасимметрические центры, когда два заместителя отличаются только абсолютной конфигурацией, входящего в них хирального элемента, и (R)- имеет приоритет над (S)-.


Но это я отвлекся. Я хотел продемонстрировать, что программа сейчас может моментально и безошибочно назвать соединение, с которым школьникам приходилось сидеть и ломать голову. А потому ценность всех этих заданий на номенклатуру представляется мне сомнительной. И вообще нужно ли учить сейчас номенклатуру органических соединений со всеми ее тонкостями, вроде тех, что я показал выше? Компьютерам намного понятнее и компактнее будет запись типа SMILES (для кубана это будет C12C3C4C1C5C2C3C45), а не все эти скобочки и верхние индексы:


А люди тоже эти систематические названия не воспринимают и норовят придумать тривиальные имена, как тот же кубан. Когда я писал диссертацию и статьи, я выводил все эти “1,3-bis(2,6-diisopropylphenyl)imidazol-2-ylidene” только в экспериментальной части. А так намного понятнее формула или сокращение “dipp-Imd”, а то и просто “IPr”. И радикал кубана (если от него атом водорода оторвать) так и хочется назвать “кубил”, а не “кубан-1-ил”.


И я бы успокоился на том, что называние химических соединений вручную осталось в истории вместе с дискетами на 3.5 дюйма. Но не тут-то было. Стоит вам поискать “cubane” в ютубе, и первая ссылка на самое просматриваемое видео будет на Khan Academy, где разбирается, как назвать кубан через “пентацикло”. Стоит вам поискать “cubane” на chemistry.stackexchage.com (такой аналог Stack Overflow, но по химии), то больше всего голосов будет у поста о систематическом названии. Никуда эта схоластика не делась, несмотря на появление автоматических номенклатурилок. Мучают детей графами и скобочками. Лучше бы тогда учили группы симметрии, если хочется побольше математики, а не химии.

Это большая проблема всех современных стандартных тестов. Задания по программированию, физике, химии подменяют математическими головоломками, решение которых можно однозначно оценить и быстро генерить много вариантов, без попыток придумать красивые задания, связанные с реальным миром. В школьной химии меня больше всего бесит “рассаживание электронов по полочкам”, которое дают без малейшего представления об уравнении Шредингера и что эти полочки на самом деле значат.

Знать таблицу умножения полезно, а вот уметь перемножать в уме двузначное число с трехзначным в компьютерную эпоху бессмысленно. Когда я готовился к олимпиадам, был у меня двухтомник Несмеянова по органической химии. Книга была издана в 1974 году, через 10 лет после синтеза кубана, но там этот синтез уже был:


(Еще одна полезная ссылка: https://djvu2pdf.com/ – где можно легко перевести советские химические книги, разбросанные по сети в djvu формате, в pdf. То, как мы в студенческие годы собирали коллекции этих файлов, – отдельная история; а теперь все находится в два клика).

А современные учебники игнорируют, что номенклатурить соединения вручную уже не надо. Не надо запоминать порядок заместителей, приоритет двойной связи над тройной и тому подобную лабуду. Я когда-то хотел создать эпп по номенклатуре углеводородов, но отказался от этой идеи. Если некоторые тривиальные названия еще имеет смысл знать (хотя бы от метана до декана, бензол-толуол), то всю эту схоластику с “пентацикло” пора оставить в прошлом.

суббота, 4 января 2020 г.

Продолжаю размышлять о профессорских перспективах

Пролистывал на днях список статей в Organic Letters и увидел знакомую фамилию со звездочкой. Ming Chen стал постдоком в группе Хартвига через полгода после меня. Но в отличие от меня он там задержался на четыре года, опубликовал 6 статей и в 2016 году стал профессором в Auburn University. Есть такой универ в алабамской глубинке. (Между прочим, на эту же позицию в тот же год претендовал другой мой знакомый).

И захотелось мне посмотреть, как Минг поживает в Оберне, зашел на сайт его группы. Поживает неплохо. После “индукционного периода” в пару лет они разогнались и уже опубликовали 15 статей, в основном в Org. Lett. Пресловутой diversity, правда, пришлось пожертвовать: группа пока состоит из пяти китайцев. Для Алабамы весьма достойный результат: если получит грант, то получит и теньюр в следующем году.

Я вспомнил другого своего солабника по группе Хартвига – непальца Рамеша Гири, который в тот же год, когда я был в Беркли, подавал на профессора и попал в Университет Нью-Мексико. Я даже к нему заезжал туда в декабре 2012 года, расспрашивал о первых впечатлениях. Он тоже набрал себе группу непальцев и серьезно взялся за публикации, которых выпустил уже 28 штук (в том числе в JACS и ACIE), и недавно я обнаружил, что он пошел на повышение и профессорствует уже в Penn State, а это универ на ступень выше, чем Нью-Мексико.

Соглашаясь профессорствовать в университетах “квадратного штата”, многие мечтают, как переведутся потом в какой-нибудь условный калтех. Не всем удается, но Рамешу, я считаю, удалось, и я за него рад. Когда мы были в группе Хартвига, он как ученый и руководитель был намного выше меня, поэтому ничего удивительного в его академическом росте нет. Но он и старше меня на 6 лет.

Минга и Рамеша роднит то, что в своей независимой карьере они решили продолжать разрабатывать те темы, над которыми работали во время своих PhD, а не те проекты, которые делали на постдоке у Хартвига. И темы на PhD у них были весьма прибыльные: как в плане публикаций, так и в плане цитирований. Можно много вариантов реакций и катализаторов предлагать, и много ученых в этих областях публикуется.

Вот тут я задумался: я в аспирантуре занимался карбен-боранами. Тема тоже была прибыльная с точки зрения публикаций (у меня их 11; у Рамеша на PhD – 17, у Минга – 20) и цитирований, львиную долю которых я получил после ухода из академии. Когда на грин-карту подавал, у меня их было 189, а сейчас почти на тысячу больше:


Но я потому и согласился делать с Хартвигом “биологический” проект, что абсолютно не верил в то, что с карбен-боранами смогу прорваться в профессора, а тем более получить под это дело гранты. Да мне самому они надоели. Цитирования цитированиями, но практического применения ни в академии, ни в индустрии они не нашли (и не найдут). Но если бы меня вдруг занесло в профессора в провинциальный универ, то с большой вероятностью я бы поступил точно так же, как и Минг с Рамешем: набрал бы русских постдоков и аспирантов и варил бы с ними карбен-бораны. Может, короткие полные синтезы делал. Надо же что-то публиковать: мне – для грантов и теньюра, моим студентам – для диссертаций.

А вот “больших идей” в химии у меня как не было тогда, так не появилось за все эти годы. Помню, как с другим русским постдоком в группе Хартвига мы обсуждали проблемы возникновения гомохиральности в живых организмах. Алексей Сергеев стал профессором (lecturer) в университете Ливерпуля в том же году, когда Рамеш начал в UNM. Алексей делал свой первый постдок в Европе и хотел туда вернуться.

За его успехами я тоже слежу, у меня даже alert в Google Scholar на его новые статьи остался. Но за эти 7 лет он опубликовал всего три статьи (зато две из них в JACS и ACIE). Он решил попробовать заняться “своей” химией, не продолжать то, что он делал на PhD или постдоке. Химия у него получилась красивая – иридиевый комплекс вставляется в бензольное кольцо – но мало кому интересная, судя по числу цитирований. Я не считаю, что это плохой результат. Двух аспирантов он защитил, гранты получает, преподает. Надо сделать поправку на то, что он в Ливерпуле получил очень мало денег вначале (подозреваю, что раз в 10 меньше, чем дали Рамешу в Нью-Мексико). И вообще британская академическая система мне плохо знакома. Насколько там важно публиковаться. Есть ли возможность взять студентов и постдоков не из Евросоюза. Но то, что в США у профессоров больше денег – факт. А потому все результаты надо пересчитывать на размер научной группы.

У самого Джона Хартвига тоже все хорошо. В 2019 году ему и Баквальду выдали Wolf Prize in Chemistry, а оттуда до Нобеля один шаг. С интересом прочитал интервью с ним в Chemistry World по этому поводу. На словах “At the same time, San Francisco is nearby, and there’s lots we do in the city, like music and theatre and other cultural events. We’ve gone to many operas over the years. Verdi’s are the best of course.“ я даже задумался – не могли ли мы с ним там пересечься. Мы же тоже были в SF Opera несколько раз за последние годы. Вряд ли. Да и не узнал бы он меня. Предложи он мне в 2012 году другой, более подходящий под мои скиллы, проект, мы бы с ним явно опубликовали статью и расстались бы в лучшем настроении.

Джону Хартвигу повезло в начале своей академической карьеры опубликовать ряд работ по реакции, которая сейчас носит имя Buckwald–Hartwig. И вот это пример если не “большой идеи”, то практической пользы. Реакция применялась бесчисленное множество раз в синтезе лекарств и природных соединений. Вот это, пожалуй, уровень, на который я готов был бы ориентироваться, если бы пошел в академию. А карбен-бораны при всей их публикабельности никому не нужны.

В конце прошлого года мой PhD руководитель Деннис Карран разослал бывшим членам группы традиционное рождественское письмо, в котором сообщил, что после 38 лет профессорства решил закрыть исследовательскую группу. Выпустил последнего, 100-го аспиранта, опубликовал 500-ую статью и 100-ую статью в JACS. Пора играть с внуками и на укулеле. Ссылку в подписи он теперь дает не на сайт группы, а на статью о себе в Wikipedia (карбен-бораны там не упомянуты).

Продуктивная карьера. И простая математика показывает, что не могли все его аспиранты стать профессорами. Иначе бы через несколько поколений все люди на Земле стали бы профессорами химии. Каррана я считаю великим профессором и своим главным учителем в химии, но не покидает меня мысль, что как ученый Хартвиг выше Каррана. Реакция Баквальда–Хартвига останется, а будет ли кто-то применять радикальную или fluorous химию, разработанную Карраном, через сто лет, я не знаю. Так и останется он в истории как “автор более 500 научных трудов”. Я всегда считал, что это минимальнейшая планка, на которую должен ориентироваться ученый. Уж производить публикации – не великая наука. И если это все, что я могу сделать в науке, то не надо мне ей заниматься. Но об этом будет мой следующий пост.

суббота, 28 декабря 2019 г.

Итоги 2019 года (финансовые)

Слушая подкасты по истории в последнее время, я осознал, что современных историков интересует не то, какой фараон родил других фараонов, а сколько рыбы съели рабочие, которые строили пирамиду для этого фараона, и сколько эта рыба стоила. В помощь историкам будущего я решил записать все наши траты с братом за 2019 год. Да и самому интересно, сколько мы в год потратили на рестораны. Никогда раньше такие вещи не считал.

Методология: cash accounting - считаю только те деньги, которые ушли со счетов в 2019 году, за несколькими исключениями, которые будут отмечены особо. Например, если билеты на Малера в Лос-Анджелесе мы покупали в 2018 году, а слушали концерт в 2019-м, то эта трата считаться не будет. Но будет учтены билеты на “Кольцо” в Чикаго, которые мы купили в этом году, а слушать будем только еще в следующем. Расходы разбиты по группам и перечислены в порядке уменьшения. Как правило даю числа с двумя значащими цифрами.

Налоги - 85000. Это и федеральные, и местные, и бизнес-лицензии. Я включил все estimated taxes за 2019 год, даже те, которые снимутся с моего счета в январе.

Аренда квартиры - 29000. Примерно 2400 в месяц, о чем я подробно писал в предыдущем посте.

Медицина - 9700. Неожиданно вышла на третье место. Но это мой брат в последние годы серьезно взялся за лечение зубов.

Медицинская страховка - 8400. Это отдельно от медицинских расходов. Ей мы почти не пользуемся. Платим около $350 в месяц каждый за страховые планы чуть лучше самого плохого с deductible в 6500.

Еда из магазинов и пекарен - 3500. То есть $290 в месяц. В эту сумму входят так же предметы гигиены типа мыла и туалетной бумаги, потому что мы покупаем их в тех же магазинах. Мы умеем покупать по хорошим скидкам и жонглируем в основном тремя магазинами, зная, что в каком покупать дешевле всего. Почти одинаковые суммы оставили в QFC (Kroger) - 1080, Trader Joe’s - 1030, Safeway - 940.

Отели - 3100. Но сюда входят как отели из четырех путешествий этого года (Аризона, Лос-Анджелес, Сан-Франциско, Орегон), так и отель в Чикаго, который уже снял деньги.

Рестораны - 1500. Из них 580 - еда в путешествиях, на которую пришлось бы потратиться в любом случае. И 960 - рестораны в Сиэтле, что можно счесть баловством. Могли бы вместо индийских буфетов питаться дома намного дешевле, но в этом году мы решили посмотреть, чем кормят в окрестных едальнях. Итого на еду 5000 в год. 420 в месяц на двоих взрослых. Так я примерно и думал, но рад, что посчитал реальное значение.

Концерты - 1400. “Кольцо” больше всего. Еще мы ходили на концерты Seattle Philharmonics и PSSO, и пойдем в Seattle Symphony на “Саломею” в марте.

Страховка на машину - 720. От Geico. Машина почти все время стоит без движения. Возможно, вариант со страховкой за пройденные мили был бы выгоднее, но мы не хотим себя ограничивать.

Интернет - 690. Это они еще что-то мудрили в этом году с циклом платежа и получилось 11 платежей, а не 12.

Перелеты - 690. Это только в Калифорнию туда-обратно два раза. В Аризону мы покупали билеты в 2018-м. В Чикаго еще не покупали.

Не-еда - 520. В основном одежда и обувь. 160 в Target еще включает моющие средства, и брат покупал себе новую компьютерную мышь. Еще тостер там купили. 120 на Amazon - купили планшет для тестирования и кое-что из одежды. Вот поэтому Prime мне не подходит. В этом году мы не покупали ни новых компьютеров, ни фотоаппаратов. В IKEA вообще не ездили. У нас все есть.

Конференция моего брата в Портленде - 515. Писал о ней тут.

Различные платежи онлайн - 400. Как рабочие (участие в программе разработчиков Apple, переводы на fiverr и т.п.), так и личные (подписка брата на Codewars, мои покупки книг на Литресе).

Мобильная связь и дата - 290. У нас Ting. Получается, что мы на двоих в месяц тратим меньше 100 минут, меньше 100 сообщений и меньше 100 Мб даты. Вот и выходит всего $24 в месяц за две линии.

Электричество - 200. Остальные коммунальные услуги включены в рент. В среднем $17 в месяц. В Сиэтле такой климат, что отопление и охлаждение в новых домах почти не требуется. Да и нет у нас кондиционера. О расходах на электричество у меня был отдельный пост.

Общественный транспорт - 200. Из них 120 в Сиэтле, и 80 - в поездках.

Музеи - 200. В Тусоне, ЛА, СФ и Портленде.

Регистрация автомобиля - 190. Недавно в штате Вашингтон состоялись выборы, где граждане штата решили на референдуме, что регистрация не должна превышать $30. Но коррумпированные демократы, которые захватили тут всю власть, заблокировали народное решение через суды. Потому что очень много денег тут воруется на инфраструктурных проектах, и отдавать их людям никто не хочет.

Бензин - 170. Тут сразу хочу предупредить будущих историков, что это нетипичная сумма для американцев в 2019 году. И если бы мы не поехали на машине в Орегон, то вообще было бы смешное число.

Стрижка - 140. Я стригся три раза, а брат – четыре. Стрижемся мы все время, как живем в Сиэтле, в одной и той же парикмахерской, в 10 минутах пешком от нашего дома. Сама стрижка тоже занимает 10 минут. Стоит $15. Мы даем $5 чаевых.

Смена масла в машине - 105. Пришлось этим заняться во время поездки в Орегон.

Годовое членство в AAA - 97. Тоже своего рода страховка.

Парки - 85. 80 - это годовой пропуск в национальные парки. 5 - плата за парк штата в Орегоне.

Комиссии по кредиткам - 78. Есть у нас у каждого по кредитке, которые берут ежегодную fee в $39. Зато кэшбек по кредиткам за год составил почти $500 в этом году. Еще $300 получили sign-up bonuses за свежеоткрытые кредитки. Но я тут расходы считаю, а не доходы.

Парковка - 13. В последний день в Портленде. Парковка в доме ($150 в месяц) включена в рент.

Fedex и USPS - 4. Причем Fedex не за доставку, а за распечатку билетов. С тех пор, как у нас сломался принтер, мы пришли к выводу, что дешевле печатать их в Fedex, чем покупать новый. В современную мобильную эпоху, наверно, можно было бы ничего не печатать, но так, для подстраховки.

Вот и все. Расходов без налогов за год – 61600. Многие столько не зарабатывают. Даже вдвоем. Квартира тут почти половина. Я часто повторяю: Сиэтл – дорогой город. С налогами расходов почти 147k. Столько даже в богатом Сиэтле не все получают. А нам еще удается откладывать деньги “на покупку дома / на черный день”. Поэтому структурой расходов я доволен. Особо экономить не на чем и незачем. А вот над увеличением доходов будем работать.

Поздравляю всех с праздниками!